中国2007-2009年HIV-1耐药基因型检测质量评估结果

• 作者: 全宇 尚红 康来仪 廖玲洁 李敬云 杨娟 汪宁 赵全璧 邢辉 邵一鸣 钟平 陈彬
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 艾滋病病毒Ⅰ型 基因型耐药 序列 质量控制 能力验证
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 206-209,217
• 页数: 5页
• 分类号: R512.91
• 语种: 中文

摘要

目的 对2007-2009年统一发放至各省,针对艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)蛋白酶和反转录酶基因的耐药突变基因型外部质控品的检测结果,进行分析和检测技术能力评价.方法 对3年共5次由各省提交的,应用实验室自建方法(In house)、Viroseq(雅培公司,Abbott)和TruGene(西门子公司,Siemens)检测系统获得的耐药基因型数据进行综合分析.质控盘由6份血浆(HIV-1 B及B/C重组毒株)组成,覆盖病毒的蛋白酶和反转录酶基因区的野生型和耐药突变型.每份序列与共享序列比较,使用扣分制对各实验室的结果进行评价.结果 除3家核心实验室外,累计有19个省23家省市级疾病预防控制中心(CDC)或医院自愿参加,共提交了 95份结果,其中3家实验室使用ViroSeq检测系统；提交了9份结果；1家使用TruGene检测系统；提交了 1份结果；其余85份使用inhouse检测系统.考核品总的序列阳性率(获得合格序列率)为97.7％,其中的低载量(1 000拷贝/mL)样本均得到阳性结果；根据累计提交的序列结果看,耐药位点判读的完全一致率为78.9％(75/95),序列编辑分析的一致率也有76.8％(73/95).参加能力验证的省市级实验室由2007年的15家增加到2009年下半年的23家,合格率(001PT)由73.3％上升到(004PT) 95.2％,3次以上优秀的实验室有13家.结论 目前的检测方法均可成功扩增中国主要亚型流行毒株.所有检测结果在各实验室间的一致性均较高,因此基因型耐药检测技术是可靠的,但各实验室检测能力也存在差异.我国具备耐药基因型检测能力的实验室数量不断增加,检测水平逐年提高.