中国幽门螺杆菌vacA基因型标签序列与VacA活性关系的分子系统发育分析

• 作者: 何震宇 杨泽民 陈伟强
• 来源期刊: 广东药学院学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 幽门螺杆菌 vacA基因型 VacA活性 分子系统发育
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 医学研究
• 页码范围: 196-199
• 分类号: Q933
• 字数: 2970字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-8783.2012.02.024

摘要

目的 探讨中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列分子系统发育关系及其对VacA活性的影响.方法 从GenBank数据库中下载所有中国幽门螺杆菌VacA全长氨基酸序列,利用ClustalX 2.0和MEGA 5.05软件对vacA基因s、m和i区氨基酸序列及VacA全长氨基酸序列进行生物信息学分析,构建分子系统发育树.结果 中国幽门螺杆菌无毒弱毒株vacA基因型全为s1/m2/i1型,而强毒株除Ch2菌株为m1 -m2杂合型之外,全为s1/m1/i1型,s1型和i1型强相关.分子系统发育分析显示,中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列都呈现明显的地理特异性,其中m区分子系统发育树能够将VacA强毒株和无毒弱毒株分开,而s和i区分子系统发育树则不能将两者完全分开.结论 vacA基因m区氨基酸序列更适合作为中国幽门螺杆菌VacA的毒力标志.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何震宇	广东药学院基础学院	31	495	8.0	22.0
2	陈伟强	广东药学院基础学院	90	567	15.0	20.0
3	杨泽民	广东药学院基础学院	39	307	10.0	16.0