广东地区流感H3N2毒株血凝素基因特征、进化和变异分析

• 作者: 侯年妹 倪汉忠 张欣 梁丽君 武婕 钟静 黄平
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 流感 H3N2毒株 HA基因 表位 进化 疫苗株
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 330-335
• 页数: 6页
• 分类号: R373.1|Q78|Q933
• 语种: 中文

摘要

为揭示广东地区2007～2010年甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因特征和变异,采用时空抽样方法抽样,检测广东2007～2010年甲型H3N2毒株HA基因核苷酸序列,同时检索全球HA基因序列作为对照,采用Lasergene　7.1和Mega 5.05软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析；并结合流行病学资料,对变异毒株进行进化速度分析；同时进行抗原分析.结果发现,广东2007～2010年H3N2毒株HA基因同义进化(Ks)和错义进化(Ka)速度分别为2.06×10-3～2.23×10-3核苷酸/年和1.05×10-3～1.21× 10-3核苷酸/年,HA1较HA2的错义突变速率要高3.13倍.与疫苗株A/Perth/16/2009的HA基因比较,2009年广东毒株同源性达到98.8％～99.7％、2010年同源性达到98.0％～98.4％.在广东2007～2010年毒株中,HA1五个抗原表位均有氨基酸位点变异,尤其是2010年毒株B区(N160K)和D区(K174R/N)的变异；此外,广东2010年毒株受体结合部位(RBS)还发生K189E/N/Q和T228A置换变异；两个糖基化位点变异影响到抗原性；目前使用的H3N2疫苗株与目前流行毒株的抗原性有差异.广东地区2007～2010年的毒株中,血凝抑制抗体的抗原分析结果有差异.结果提示,目前广东乃至全球甲型H3N2毒株HA1B区和D区均有氨基酸位点变异,RBS的两个位点发生置换,糖基化位点变异影响到表位A区和B区抗原性；与WHO推荐2011年流感H3N2毒株疫苗株比较,目前流行毒株HA基因有抗原位点变异.