水稻中Intronic MicroRNA与其宿主基因功能关系分析

• 作者: 王胜华 童永鳌
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: Intronic microRNA 宿主基因 功能关系 GO富集分析 水稻
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1342-1348
• 页数: 7页
• 分类号: Q752
• 字数: 3657字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2012.06.031

摘要

根据已有的水稻基因组注释,对水稻中已知的437个 pre-miRNAs 的基因组背景加以分析,有98个(～22％)与蛋白编码基因相重叠,其中69个(～16％)位于蛋白编码基因的内含子区域,即intronic microRNAs (in-miRNAs).对这些in-miRNAs的靶基因进行Gene Ontology(GO)富集分析,结果显示in-miRNAs对蛋白质氨基酸磷酸化,DNA整合,蛋白质水解,恒温保持,防御响应等生物学过程中的基因有明显的调控作用.最后,对宿主基因及靶基因的功能进行整合分析发现有4个in-miRNAs所调控的靶基因与其宿主基因参与了相同的生物过程、我们推断,in-miRNAs可能会在这些生物过程中,通过下调靶基因的表达来协助或抑制其宿主基因的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王胜华	四川大学生命科学学院	64	759	16.0	24.0
2	童永鳌	四川大学生命科学学院	3	1	1.0	1.0