芹菜非特异性脂转移蛋白基因的克隆与表达分析

• 作者: 侯喜林 刘梦叠 李梦瑶 熊爱生 王枫 王镇 蒋倩 马静
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芹菜 脂转移蛋白 基因克隆 实时定量PCR 基因表达
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 1293-1302
• 分类号: S636.3
• 语种: 中文

摘要

以芹菜（Apium graveolens）‘六合黄心芹’、‘津南实芹’和‘美国西芹’为试验材料,采用RT-PCR技术分别获得其cDNA序列。序列分析表明：来源于3个芹菜品种的非特异性脂转移蛋白（Non-specific lipid transfer protein,nsLTP）基因核苷酸序列高度保守,全长357bp,编码118个氨基酸,起始密码子ATG之后含有27个氨基酸残基的信号肽序列,推测其成熟的蛋白含91个氨基酸残基,预测其蛋白质分子量为11.75kD,pI值为9.36。芹菜的nsLTP蛋白主要由α-螺旋和随机卷曲组成。空间结构上分析显示,芹菜nsLTP蛋白中H1区域明显分为H1a和H1b两个亚区域,而模板碧桃中H1区域为一个连续的螺旋结构,存在明显的差异。进化分析显示,芹菜nsLTP与香石竹、大洋洲滨藜等植物的nsLTP相似性较高,在保守位置具有8个半胱氨酸残基。实时定量PCR表达分析表明,该基因主要在芹菜的茎以及茎尖生长活跃中心表达,具有明显的组织特异性。