食管癌细胞系KYSE150中RNA干扰MTA1的基因芯片分析

• 作者: 付明 刘健 孟希亭 张素洁 张雪燕 林晨 梁萧 王海娟 胡毅 钱海利
• 来源期刊: 癌症进展
• 学科: 医学
• 关键词: MTA1 肿瘤转移 食管癌 RNA干扰 基因芯片
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 肿瘤转移理论模型专栏
• 页码范围: 211-215
• 页数: 5页
• 分类号: R735.1
• 字数: 3626字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-1535.2012.03.003

摘要

目的 探讨MTA1对食管癌转移相关基因的影响.方法 用RNA干扰的方法在食管癌细胞系KYSE150中沉默MTA1基因的表达,随后进行转移相关基因芯片分析.以两次芯片分析中均上调2倍以上(或下调1/2)为差异显著基因.通过DIVID生物信息学数据库进行gene ontology的通路分析.结果 在两次基因芯片分析中均有意义上调的基因共有7个,分别是LAMC1、MMP14、MMP15、MDM2、API5、ODC1、PTGS2;而两次均显著下调的基因共有14个,它们是CSF1R、HGF、IGF2、ITGA6、MMP9、MMP11、MMP13、CASP8、CTSD、TMPRSS4、THBS2、TIMP1、ENPP2、SNCG.通过在DAVID生物信息学数据库中对上述表达差异显著的基因进行通路分析,结果提示差异基因主要富集在5条信号通路上,分别是肿瘤信号通路(MDM2、CASP8、CSF1R、HGF、ITGA6、LAMC1、MMP9、PTGS2)、ECM受体整合信号通路(LAMC1、THBS、ITGA6)、基质金属蛋白酶信号通路(TIMP1、MMP9)、小细胞肺癌信号通路(ITGA6、Cox2)和黏着斑信号通路(ITGA6、HGF、IGF2).结论 MTA1参与了转移相关的一系列分子改变事件,尚需进一步的分子生物学方法验证这些基因调控的信号途径.