冠心病血瘀证遗传相关的差异基因筛选及其功能路径分析

• 作者: 刘群良 喻松仁 孙贵香 李杰 王丽萍 王萍 简维雄 袁肇凯 郑景辉 黄献平
• 来源期刊: 中国中西医结合杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 冠心病 血瘀证 遗传 家系 差异基因
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 临床论著
• 页码范围: 1313-1318
• 分类号: R4
• 字数: 4915字
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨冠心病(coronary heart disease,CHD)血瘀证遗传相关的差异基因功能及目标通路.方法 以家系CHD血瘀证者(A组)及家系CHD非血瘀证者(B组)、家系非CHD血瘀证者(C组)、家系健康人(D组)、非家系CHD血瘀证者(E组)、非家系健康人(F组)为研究对象,应用基因芯片技术比较A组与B、C、D、E组,以及D组与F组的差异基因表达谱；通过基因本体论( gene ontology,GO)分析阐释差异基因的分子功能；通过BioCarta及KEGG网站寻找差异基因所在通路,应用超几何分布统计学方法分析筛选出有意义的目标通路,并用实时荧光定量RT-PCR对差异基因进行验证.结果 (1)通过对基因芯片数据的筛选(差异倍数≥3),发现家系CHD血瘀证差异基因表达主要涉及趋化因子、白介素细胞因子、补体系统、基质金属蛋白酶系、成纤维细胞生长因子、内皮细胞黏附因子等.(2)通过相关差异基因(P ＜0.05)GO分析,找到与CHD血瘀证相关的差异基因的分子功能.(3)经过BioCarta及KEGG通路分析,发现家系CHD血瘀证与遗传相关的差异基因中差异有统计学意义(P＜0.05)的目标通路主要涉及到炎症、斑块形成、内皮损伤等方面.经实时荧光定量RT-PCR反应验证了基因芯片准确可靠.结论 CHD血瘀证遗传相关的差异基因与炎症、斑块形成及血管内皮损伤密切相关.