利用文本数据挖掘研究p53基因表达调控网络

• 作者: 余庆 吴咏竹 李津臣 舒坤贤
• 来源期刊: 重庆邮电大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 文本数据挖掘 p53基因 基因本体 连锁聚类分析
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 通信、电子及其他
• 页码范围: 798-803
• 页数: 6页
• 分类号: Q354
• 字数: 3479字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3979/j.issn.1673-825X.2012.06.025

摘要

为了研究p53基因与其下游/靶基因的关联性,以了解p53基因表达调控网络,采用文本数据挖取方法,利用自编的Perl 5.10程序,对PubMed文献数据库中p53基因相关文献及人类基因本体数据库进行数据挖掘,并利用连锁聚类法构建p53基因表达调控网络图.结果发现,目标基因的频率分布同文本中所有基因本体的频率分布存在一定的关联性,低频基因的文本挖掘比例明显低于高频基因的文本挖掘比例.从而说明,p53基因表达调控网络中各基因的分布情况与基因频率有较大关系,而文本数据量对文本数据挖掘的准确率也有重要影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	舒坤贤	重庆邮电大学生物信息学研究所	64	491	10.0	21.0
2	余庆	重庆邮电大学生物信息学研究所	1	1	1.0	1.0
3	李津臣	重庆邮电大学生物信息学研究所	1	1	1.0	1.0
4	吴咏竹	重庆邮电大学生物信息学研究所	1	1	1.0	1.0