下一代测序技术数据中的选择性剪切计算识别方法研究

• 作者: 李旭斌 林子雨 林琛 江弋 邹权
• 来源期刊: 电子学报
• 学科: 工学
• 关键词: 下一代测序技术 RNA_seq 选择性剪切 剪切位点 读段定位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 综述评论
• 页码范围: 350-357
• 分类号: TP391
• 字数: 6055字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0372-2112.2012.02.023

摘要

随着测序技术的发展,下一代测序技术(Next-Generation Sequencing)给生物信息学领域研究带来了新的机遇和挑战.由于选择性剪切(alternative splicing,AS)在真核生物基因表达和蛋白质多样性方面的重要性,识别选择性剪切位点一直都是研究的重点.下一代测序技术的出现,使得选择性剪切研究的计算方法不断地变化.介绍了选择性剪切过去和目前研究的状况,然后总结了基于RNA-seq数据的选择性剪切研究方法、软件以及数据库,并利用了RNAseq数据比较了相关软件,最后讨论了选择性剪切中计算方法的发展方向和前景.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江弋	厦门大学信息科学与技术学院	20	124	5.0	10.0
2	邹权	厦门大学信息科学与技术学院	23	446	9.0	21.0
3	林子雨	厦门大学信息科学与技术学院	26	525	9.0	22.0
4	林琛	厦门大学信息科学与技术学院	19	447	7.0	19.0
5	李旭斌	厦门大学信息科学与技术学院	1	5	1.0	1.0