ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs相关信号通路的分析

• 作者: 吴钢 姜茂竹 张积仁 曾融 郑燕芳 麦仲伦
• 来源期刊: 中华肿瘤防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺肿瘤 受体,雌激素 microRNAs 信号传导 计算生物学
• 年，卷（期）: 2012,（23）
• 所属期刊栏目: 临床基础研究/论著
• 页码范围: 1795-1799
• 分类号: R737.9
• 语种: 中文

摘要

目的:利用生物信息的方法,建立一种对不同ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs生物学功能和信号通路系统分析的方法,探讨microRNAs在不同ER状态中可能发挥的调控作用.方法:通过文献挖掘,找出不同ER表达状态乳腺癌差异表达microRNAs,利用预测软件TargetScan、PicTar、miRanda和TarBase数据库得出microRNAs可能靶向的基因集,对靶基因集进行去除随机化的富集分析后,再利用DAVID数据库进行相关生物学功能和信号通路分析.结果:通过文献挖掘的方法找到了5个不同ER表达状态乳腺癌microRNAs差异表达数据集,分别包含了11、43、25、6及19个差异表达的microRNAs.经过靶基因预测及富集后,得到的不同microRNAs靶基因集分别包括1 553、1 750、1 905、1 250和1 826个靶基因.进一步功能及通路分析发现,这些靶基因集可能参与转录相关蛋白质定位及转移、RNA代谢、细胞周期、细胞凋亡和细胞分裂等多个生物学过程,并发现3条共同的BIOCARTA细胞信号通路可能与ER表达调节相关.结论:找到了不同ER表达状态乳腺癌差异表达的microRNAs,并利用生物信息学方法对这些microRNAs进行系统分析,为进一步研究microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化中的调控机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张积仁	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	167	747	12.0	19.0
2	郑燕芳	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	27	103	6.0	8.0
3	曾融	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	8	12	2.0	3.0
4	姜茂竹	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	13	19	2.0	3.0
5	麦仲伦	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	7	17	2.0	3.0
6	吴钢	南方医科大学珠江医院肿瘤中心	8	29	3.0	5.0