利用EcoTILLING简化技术进行水稻基因型鉴定及单核苷酸多态性(SNP)检测

• 作者: 吴敬德 宣红 张瑛 朱学桂 李泽福 滕斌 罗志祥
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: EcoTILLING CEL I 水稻 基因型 SNP
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 254-260
• 分类号: S511
• 字数: 3834字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.03.004

摘要

EcoTILLING(ecotype targeting induced local lesions in genomes)是一种高通量检测和分析自然群体中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变异的研究方法.由于该技术需要高级、精密的仪器设备和昂贵的荧光标记引物来检测CEL(celery)I的酶切产物,极大地限制了该技术的应用.本研究对传统EcoTILLING技术做了适当改进,简化了CELI酶的抽提步骤,采用自然冷却方法制备异源双链产物,普通银染检测CELI酶切产物,酶活检测结果显示CELI粗提液对错配产物切割效果良好.利用EcoTILLING简化技术对18份水稻(Oryza sativa L.)品系Wx基因第1内含子5’端的G/T基因型进行了成功鉴定.此外,对18份水稻材料中一417 bp长的Wx基因片段实现了CELI酶切条带分型,经测序验证,酶切带型差异能够准确反映材料间SNP的变异.本研究结果表明,应用EcoTILLING简化技术可有效进行水稻基因型鉴定及SNP检测,是开展水稻功能基因组研究的有力工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李泽福	安徽省农业科学院水稻研究所	45	545	11.0	22.0
2	张瑛	安徽省农业科学院水稻研究所	27	293	10.0	16.0
3	吴敬德	安徽省农业科学院水稻研究所	26	338	11.0	18.0
4	罗志祥	安徽省农业科学院水稻研究所	44	359	12.0	17.0
5	滕斌	安徽省农业科学院水稻研究所	9	94	3.0	9.0
6	朱学桂	安徽省农业科学院水稻研究所	2	18	2.0	2.0
7	宣红	安徽省农业科学院水稻研究所	6	62	4.0	6.0