黄瓜S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶全长cDNA的克隆及表达分析

• 作者: 周秀艳 武涛 秦智伟 金晓霞
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶 克隆 表达 蛋白结构预测
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1338-1346
• 分类号: S855.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.07.011

摘要

[目的]克隆黄瓜S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因的cDNA,并进行生物信息学和表达分析,为研究该基因的功能奠定基础.[方法]通过对乙烯利诱导黄瓜茎尖SSH文库的筛选,采用RT-PCR和电子克隆技术,获得黄瓜CsSAHH基因的cDNA全长序列(NCBI编号:HQ444960,CsSAHH).运用半定量RT-PCR,分析CsSAHH基因在乙烯利诱导后的茎尖和雌雄花不同部位的表达.通过生物信息学方法预测CsSAHH基因的蛋白结构.[结果]黄瓜CsSAHH基因的cDNA全长1 545 bp,编码485个氨基酸,其理论上的等电点pI=5.66,分子量MW=53.1 kD.CsSAHH基因在黄瓜茎尖受乙烯利诱导增强表达,在黄瓜雄花中的雄蕊表达较弱.CsSAHH理化性质表明,该蛋白无明显的信号肽；蛋白二级结构主要由loop环和α螺旋构成,含少量的β折叠,预测发现该蛋白分别在85-99氨基酸残基和262-279氨基酸残基处各有1个S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶活性功能区.CsSAHH基因氨基酸序列与苜蓿的同源性为63％,与水稻、玉米、拟南芥等作物同源性较低.[结论]成功克隆黄瓜CsSAHH基因cDNA序列,在85-99氨基酸残基和262-279氨基酸残基处各有1个S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶活性功能区.该基因在茎尖受乙烯利诱导增强表达,在雄蕊中表达较弱.在未处理的雌雄花芽发育不同阶段,雌花芽中表达强于幼果和雄花芽.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周秀艳	东北农业大学园艺学院	111	1188	17.0	28.0
2	秦智伟	东北农业大学园艺学院	170	2065	23.0	34.0
3	武涛	东北农业大学园艺学院	28	274	9.0	16.0
4	金晓霞	东北农业大学园艺学院	20	89	3.0	9.0