小金海棠缺铁胁迫相关miR394a的克隆与表达分析

• 作者: 于昌江 孙瑞 张新忠 王忆 韩振海
• 来源期刊: 内蒙古农业大学学报（社会科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: MicroRNA 小金海棠 Real-time PCR 铁胁迫
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 158-162
• 分类号: S661.1
• 字数: 5546字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-4458.2012.05.029

摘要

为了研究铁高效植物小金海棠的miRNAs信息及在缺铁处理下miRNA的表达变化,以进一步了解小金海棠缺铁分子调控机制.以改良CTAB法提取的总RNA为模板,从小金海棠中分离得到miR394a.通过Real-time PCR检测miR394a的表达,并利用生物信息学方法预测了miR394a的靶基因及其功能.miR394a具有高度保守性,从小金海棠中分离的miR394a与其他物种的miR394a序列高度相似.缺铁胁迫后,小金海棠的miR394a在根及叶中都有表达,但表达模式有所不同,miR394a在根部响应较为迅速,缺铁处理1天时,即有上调表达；而在叶片的响应较晚,缺铁3天时有上调表达.miR394a的靶基因预测表明,miR394a主要调控转录因子及参与代谢途径的基因.结果表明,miR394a受缺铁胁迫所诱导,参与了小金海棠缺铁调控途径,在缺铁调控中起重要作用.