利用DNA池技术提高基于InDel标记的种子纯度鉴定效率

• 作者: 余景会 兰青阔 张桂华 朱珠 李欧静 王永 程奕 赵新 郭永泽 陈锐
• 来源期刊: 种子
• 学科: 农学
• 关键词: DNA池 InDel标记 焦磷酸测序技术 黄瓜 种子纯度鉴定
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 31-33,38
• 分类号: S642.2
• 字数: 2447字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4705.2012.02.008

摘要

为提高基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测通量,降低检测成本,本研究模拟10种DNA Pooling进行PCR、Pyrosequencing及等位基因频率分析.通过TTest分析不同Pooling间等位基因频率的差异性,确定3 Pooling为种子纯度检测最适Pooling数;建立3 Pooling-InDel-Pyrosequencing标准曲线,其R2达0.999 1;根据该标准曲线,检测黄瓜杂交品种“园中王”30粒杂交种种子纯度,结果为96.67％.本研究丰富了基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测技术体系.