长牡蛎钙调蛋白基因克隆及多态性分析

• 作者: 于旭蓉 仇雪梅 刘洋 常亚青 王秀利
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 长牡蛎 钙调蛋白 基因克隆 多态性分析 SMART RACE EPIC-PCR PCR-SSCP
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·桑蚕
• 页码范围: 855-860
• 分类号: S944.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2012.06.855

摘要

[目的]从钙调蛋白(CaM)基因克隆和序列分析入手,对长牡蛎CaM基因的功能进行深入研究,为生产实践提供参考依据.[方法]利用SMART RACE和EPIC-PCR技术克隆长牡蛎CaM基因,然后采用PCR-SSCP技术和DNA测序方法分析长牡蛎CaM基因编码区多态性.[结果]扩增获得长牡蛎CaM基因cDNA全长序列为917 bp,包括开放阅读框(ORF)全长450 bp,编码149个氨基酸；5′非编码区含222 bp,3′非编码区含245 bp; ORF内有3段内含子序列,分别为Intron-1:110 bp、Intron-2:137 bp和Intron-3:143 bp.PCR-SSCP分析获得C5引物野生型TT型、突变型GG型和杂合型GT型3种基因型.基因型和等位基因频率统计结果表明,GG型和G等位基因频率明显高于TT型和T等位基因；而最小二乘分析结果表明,CaM基因位于ORF内第158位T→G的SNPs位点,对长牡蛎的壳重有显著性影响(P＜0.05),但对壳长、壳高、壳宽、体总重及肉重无显著影响.[结论]CaM基因对长牡蛎贝壳形成具有一定的影响作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	仇雪梅	大连海洋大学水产与生命学院	22	59	5.0	6.0
2	于旭蓉	大连海洋大学水产与生命学院	24	53	5.0	6.0
3	刘洋	大连海洋大学水产与生命学院	66	95	4.0	6.0
4	王秀利	大连海洋大学水产与生命学院	31	126	7.0	9.0
5	常亚青	大连海洋大学水产与生命学院	142	766	15.0	19.0