家蚕JAK/STAT信号通路相关基因克隆与分析

• 作者: 何蕾 张晓丽 彭景琨 曹广力 薛仁宇 贡成良 钱莹 马焕艳
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 家蚕 JAK/STAT通路 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（17）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 3592-3601
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.17.016

摘要

[目的]鉴定家蚕JAK/STAT信号通路组成原件,并预测家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因的功能.[方法]在电子克隆的基础上,通过RT-PCR获得家蚕JAK/STAT信号通路的主要相关基因；利用在线软件对相关蛋白进行结构域分析；基于microarray数据库或qPCR分析各基因的组织表达特征.[结果]克隆了家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因,包括BmSTAT、BmHOP、BmSOCS2、BmSOCS5A、BmSOCS5B、BmSOCS6、BmDRK、Bmken、BmPIAS1、BmPIAS2以及BmPI3K,但没有能克隆到果蝇Upd1、Upd2和Upd3的同源体基因.序列分析显示BmHOP具CRD_FZ、Kringle、转膜区域和PKc超家族蛋白激酶催化结构域TyrKc; BmSTAT有2种亚型,均具SH2、STAT_bind、STAT_int和STAT_alpha结构域；在克隆的BmSOCS家族的3个基因中,BmSOCS2A和BmSOCS6A具典型的SH2和SOCS结构域；BmDRK由SH3和SH2两种结构域形成了SH3-SH2-SH3串联结构；BmKen存在BTB和锌指结构域,BmPIAS1和BmPIAS2具有LCR结构域,BmPI3K具有2个SH2结构域.[结论]成功克隆了家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因.相关蛋白的保守结构域分析显示,在家蚕JAK/STAT信号通路中,BmHOP是JAK激酶的一种,可以磷酸化BmSTAT转录因子,激活靶基因转录；BmSOCS、Bmken、BmPIAS1以及BmPIAS2对JAK/STAT通路起负反馈作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛仁宇	苏州大学基础医学与生物科学学院	110	944	17.0	24.0
2	曹广力	苏州大学基础医学与生物科学学院	136	1198	19.0	28.0
3	彭景琨	苏州大学基础医学与生物科学学院	4	17	2.0	4.0
4	张晓丽	苏州大学基础医学与生物科学学院	2	16	2.0	2.0
5	马焕艳	苏州大学基础医学与生物科学学院	3	20	3.0	3.0
6	何蕾	苏州大学基础医学与生物科学学院	9	47	3.0	6.0
7	钱莹	苏州大学基础医学与生物科学学院	1	11	1.0	1.0
8	贡成良		1	11	1.0	1.0