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甘草鲨烯合酶基因多态性对其编码酶催化效率影响的研究
甘草鲨烯合酶基因多态性对其编码酶催化效率影响的研究
作者:
刘春生
刘颖
张宁
文浩
王学勇
陈宏昊
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘草
SQS
基因多态性
单核苷酸多态性
插入与缺失多态性
选择性剪接
原核表达
GC-MS
鲨烯
摘要:
目的:分析甘草鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)基因多态性及其对编码酶催化效率的影响,为揭示优质甘草形成的分子机制奠定基础.方法:提取甘草总RNA; PCR扩增其SQS基因编码序列;测序后分析SQS序列的多态性;将具有明显差异的4个甘草SQS序列(SQS1C,SQS1F,SQS2A,SQS2B)连入表达载体pET-32a(+),转化大肠杆菌BL21;IPTG诱导蛋白表达,纯化后用于体外酶促反应;GC-MS鉴定产物并比较相对含量.结果:甘草SQS1基因存在单核苷酸多态性(single nuclear polymorphisms,SNPs)、插入与缺失多态性(InDel)、选择性剪接(AS)多态性;SQS2基因只存在SNPs.氨基酸序列分析显示,SQS1非保守替换占53.94%,结构域中有2个位点突变;SQS2非保守替换占60%,结构域中有1个位点突变.在4种编码酶的体外酶促反应中,利用GC-MS均能检测到产物生成;SQS1F编码酶积累鲨烯的能力高于其他序列.结论:甘草SQS基因具有丰富的多态性,其编码酶催化效率差异显著,这可能是优质甘草形成的分子基础.
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篇名
甘草鲨烯合酶基因多态性对其编码酶催化效率影响的研究
来源期刊
中国中药杂志
学科
关键词
甘草
SQS
基因多态性
单核苷酸多态性
插入与缺失多态性
选择性剪接
原核表达
GC-MS
鲨烯
年,卷(期)
2012,(24)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
3777-3783
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.4268/cjcmm20122420
五维指标
作者信息
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姓名
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1
刘颖
北京中医药大学中药学院
105
760
12.0
24.0
2
刘春生
北京中医药大学中药学院
159
1169
18.0
27.0
3
王学勇
北京中医药大学中药学院
34
336
12.0
17.0
4
张宁
北京中医药大学中药学院
22
81
4.0
8.0
5
陈宏昊
北京中医药大学中药学院
7
24
3.0
4.0
6
文浩
北京中医药大学中药学院
5
19
2.0
4.0
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中国中药杂志
主办单位:
中国药学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1001-5302
CN:
11-2272/R
开本:
大16开
出版地:
北京市东直门内南小街16号
邮发代号:
2-45
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
15538
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36
总被引数(次)
236207
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