无菌性脑膜炎暴发中病原学检测及埃柯30型肠道病毒的基因特征和分子进化分析

• 作者: 刘建忠 林碧莲 翁育伟 郑友限 陈明春 陈炜
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 无菌性脑膜炎 埃柯30型肠道病毒 VP1基因
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 667-671
• 分类号: R515.2
• 语种: 中文

摘要

目的 了解引起福建省泉州地区2011年无菌性脑膜炎暴发疫情的埃柯30型肠道病毒(echovirus 30,ECHO30)病原及基因特征,分析基因变异情况及进化来源.方法 对泉州市2011年无菌性脑膜炎暴发疫情中的临床样本采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)方法进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)核酸检测,随机选5份阳性样本进行肠道病毒VP1区核苷酸序列测定,将测序所得VP1序列用BLAST程序在GenBank上序列搜寻比对,确定其基因型,并通过构建进化树分析其遗传进化规律.结果 47份样本经rRT-PCR检测,有39份非EV71和Cox A16的其他肠道病毒核酸阳性,5份阳性样本的肠道病毒VP1区核苷酸序列均为876 bp,且同源性最高,均大于98.9％,最高仅相差一个核苷酸,与它们具有较高同源性的均是ECHO30.与本次分离株亲缘关系最近的一组ECHO30分别是2008年河南省和浙江省的分离株,与中国台湾2001年无菌性脑炎分离株以及印度2011年分离株则距离较远；原型株Bastianni和20世纪90年代美国分离株和本次分离到的ECHO30毒株距离最远.结论 2011年ECHO30在泉州地区发生一定程度的传播流行,并导致无菌性脑膜炎疫情的局部暴发流行,进化树分析表明本次分离株与国内近年ECHO30分离株亲缘关系较近,而与国外分离株则相对较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	翁育伟		50	174	6.0	10.0
2	刘建忠		15	48	3.0	6.0
3	陈明春		27	36	3.0	4.0
4	郑友限		19	34	3.0	4.0
5	陈炜		10	44	4.0	6.0
6	林碧莲		2	3	1.0	1.0