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基于rbcL和matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置
基于rbcL和matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置
作者:
孔卫青
杨金宏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
rbcL
matK
马鞭草科
豆腐柴属
系统学
摘要:
为探究适用于马鞭草科植物的DNA条形码及该类群的系统分类关系,对豆腐柴(Premna microphylla)的叶绿体基因ycf6-psbM、trnV-atpE、rbcL、trnL-F、psbM-trnD、atpB-rbcL、trnC-ycf6、trnH-psbA、rpl36-infA-rps8和核基因ITS序列进行了PCR扩增和测序,结果表明,仅rbcL、trnl-F、trnH-psbA序列的PCR扩增以及测序效果较好,而ITS不能得到明显的扩增条带,ycf6-psbM不能成功测序,其它序列存在有部分双峰或噪值高等问题.根据DNA条形码标准,rbcL序列是所有测试条码中相对最适合的.应用rbcL和matK序列对马鞭草科(Verbenaceae)豆腐柴属、牡荆属(Vitex L.)、马鞭草属(Verbena L.)和大青属(Clerodendrum L.)等4属与唇形科宝盖草属(Lamium L.)、水苏属(Stachys L.)、鼠尾草属(Salvia L.)和香科科属(Teucrium L.)等4属的分类和系统发育关系进行分析,以紫草科Lithospermum multiflorum L.为外类群,最大简约法对2个片段的单独和联合矩阵分别构建系统发育树.豆腐柴属和大青属应从马鞭草科划入唇形科,马鞭草属仍归于马鞭草科,而牡荆属的系统学位置还需更多的证据.
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文献信息
篇名
基于rbcL和matK序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置
来源期刊
热带亚热带植物学报
学科
关键词
rbcL
matK
马鞭草科
豆腐柴属
系统学
年,卷(期)
2013,(2)
所属期刊栏目
植物系统学与生物地理学
研究方向
页码范围
116-122
页数
7页
分类号
字数
3642字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1005-3395.2013.02.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
孔卫青
安康学院陕西省蚕桑重点实验室
37
87
5.0
8.0
2
杨金宏
安康学院陕西省蚕桑重点实验室
40
80
4.0
8.0
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引文网络
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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热带亚热带植物学报
主办单位:
中国科学院华南植物园
广东省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-3395
CN:
44-1374/Q
开本:
大16开
出版地:
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2032
总下载数(次)
6
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