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摘要:
水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae)和细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)是水稻种子产地检疫中最重要的两种检疫对象,且同属于水稻黄单胞杆菌.本研究基于生物信息学技术构建比较基因组学算法对两种病原的全基因组序列比对分析,得到一系列能够区分两种病原的特异性PCR引物.结合简单的PCR技术及全自动DNA分析系统,我们选取了12对引物分别对23株水稻白叶枯病菌和5株水稻细菌性条斑病菌及其它相关菌株进行验证.结果获得了2对显性标记(Xoo-Hpa1和Xoc-ORF2)以及3对共显性分子标记(M568、M897和M1575)可以达到理想的区分检测两种病原的效果.分子标记的检测灵敏度从5×104到5×107cfu·mL-1不等,且从水稻种子浸提液中也能成功地检测水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌.本研究丰富了检测标记的靶位点,并有效的结合了高通量检测的手段对多位点联合分析,增强了检测的可靠性,有望在今后的植物检疫及病原鉴定中发挥着重要的作用.
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文献信息
篇名 水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的分子标记筛选及检测
来源期刊 植物病理学报 学科 农学
关键词 水稻白叶枯病菌 水稻细菌性条斑病菌 分子标记 植物检疫
年,卷(期) 2013,(6) 所属期刊栏目 病原学
研究方向 页码范围 581-589
页数 9页 分类号 S435.111
字数 5578字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 储昭辉 作物生物学国家重点实验室/山东省农业微生物重点实验室 1 11 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
水稻白叶枯病菌
水稻细菌性条斑病菌
分子标记
植物检疫
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物病理学报
双月刊
0412-0914
11-2184/S
大16开
中国农业大学植保楼406室
82-214
1955
chi
出版文献量(篇)
2207
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3
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36165
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金
英文译名:
官方网址:http://web.sdstc.gov.cn/html/2004/06/20040608093820-1.htm
项目类型:高新技术领域和学科发展前沿
学科类型:
高等学校博士学科点专项科研基金
英文译名:
官方网址:http://std.nankai.edu.cn/kyjh-bsd/1.htm
项目类型:面上课题
学科类型:
论文1v1指导