水稻条斑病菌内源质粒分析

• 作者: 何勇强 姜伟 尹朝群 曾晨 朱平川 李康佳 牛祥娜 赵嘉城
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 水稻条斑病菌 内源质粒 调查 酶切图谱 抗逆基因
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 1718-1727
• 页数: 10页
• 分类号: S435.111.49
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.08.10

摘要

[目的]明确水稻条斑病菌(Xanthomonasoryzaepv.oryzicola,简称Xoc)内源质粒分布状况、类型及其含有的主要功能基因,为下一步开展该菌与质粒相关的毒力进化研究、抗逆机制分析及穿梭载体构建打下基础.[方法]采用数据库检索法和质粒分离鉴定法,调查水稻条斑病菌内源质粒的分布状况;以GenBank数据库中Xoc菌株基因组序列为研究对象,开展质粒信息检索,并对已发表的Xoc内源质粒序列进行系统进化分析;以Xoc中国菌株菌种库为研究对象,采用碱裂解法提取质粒,进行质粒酶切带型分析和主要功能基因鉴定.[结果]GenBank全基因组数据库中Xoc菌株内源质粒检出率为11.76％,系统进化分析结果表明这些质粒属于不同的进化分支.在257株Xoc中国菌株中,有29株菌株含有质粒,质粒检出率为11.28％,带有内源质粒的菌株均来自于华南稻区,且大部分来自广西.通过质粒酶切图谱比较,确认新发现的质粒属于9种新型Xoc内源质粒.按照已知Xoc内源质粒pXOCgx01上主要功能基因序列设计引物,PCR扩增结果表明新鉴定的Xoc质粒含有重金属抗性和DNA转移相关的基因,但在菌株间存在明显的多样性.[结论]部分Xoc菌株中含有一定数量的内源质粒,质粒类型和所含功能基因等具有一定的多样性,携带内源质粒的Xoc菌株有明显地域性.