2009～2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析

• 作者: 余斐 吴英萍 崔大伟 杨先知 秦志梅 范剑 谢国良 郑书发 陈瑜
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 甲型H1N1流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 建模
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 基础实验诊断研究
• 页码范围: 272-275
• 页数: 4页
• 分类号: R373.1+4
• 字数: 3110字
• 语种: 中文

摘要

目的 研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变.方法 用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息学软件对HA和NA基因序列进行进化分析.结果 建立的RT-PCR可成功检测HA(C)、HA(D)和NA基因,遗传进化分析结果表明,杭州地区甲型H1N1流感病毒的HA与NA氨基酸序列的亲缘系数与WHO推荐的病毒株及国内代表株的同源性均为98.9％ ～ 100％；三维构象结果表明,HA编码的蛋白质有5个位点发生改变,而NA编码的蛋白质仅发生2个位点改变.结论 2009年至2011年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列与世界范围内流行的病毒参考株具有高度同源性,但HA与NA蛋白质表位存在某些氨基酸位点的改变.