不同产区厚朴 nrDNA ITS 序列分析及亲缘关系鉴定

• 作者: 杨志玲* 杨旭 王洁
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: nrDNA ITS 序列 厚朴 系统聚类 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 35-41
• 分类号: Q789
• 字数: 4612字
• 语种: 中文

摘要

以陕西、四川、浙江、重庆、福建、广西主产区的11个种源厚朴为材料,采用 PCR 直接测序法,测定不同产区厚朴的核糖体 DNA ITS 区序列,并结合 GeneBank 中相关植物的 ITS 序列(以同属近缘物种辛夷为外类群),应用 Kimura‐2遗传距离与 NJ 系统树分析法对不同产区厚朴的亲缘关系进行分析.结果表明:11个产区厚朴的 ITS 全序列长度介于593~600 bp ,其中,ITS1长度为214~217 bp ,G + C 含量为54.42%~55畅35%,ITS2长度为215~219 bp ,G + C 含量为59.82%~60.95%;ITS 序列共有36个变异位点,均出现在ITS1(7个)和 ITS2(29个)序列中,虽然位点变异与部分叶形变化出现吻合,但无必然联系;序列间遗传分化距离为0.000~0.02792,11个产区厚朴构成3个分支,显示出产区间厚朴的亲缘关系,其中陕西洋县(SXYX)、陕西西乡(SXXX )、福建武夷山(FJWYS)及四川彭州(SCPZ)四个产区 ITS 序列完全一致. nrDNA ITS 序列分析可作为厚朴不同产区亲缘关系鉴定的手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨旭	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	46	580	15.0	22.0
2	王洁	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	16	102	6.0	10.0
3	杨志玲*	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	1	15	1.0	1.0