微生物代谢网络模块性与鲁棒性分析

• 作者: 李贵生 郑浩然
• 来源期刊: 北京生物医学工程
• 学科: 医学
• 关键词: 代谢网络 模块度 鲁棒性 微生物
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 47-52,57
• 页数: 7页
• 分类号: R318.04
• 字数: 4220字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3208.2013.01.10.

摘要

目的 模块性和鲁棒性是微生物代谢网络的2个重要性质,但对于模块性和网络的结点度分布间的关系、网络鲁棒性和物种环境间的关系等问题仍不清楚.方法 基于KEGG的代谢数据库,构建了已有全基因组序列的1015种微生物代谢网络,利用现有方法计算了代谢网络的模块性和鲁棒性,分析了网络模块性和结点度分布、鲁棒性和物种环境间的关系.结果 微生物代谢网络的模块度显著高于度序列相同的模拟随机网络,而其紧密度低于这些随机网络.生活环境变化性大的物种的环境鲁棒性也较高,环境鲁棒性好的物种在自身环境下的网络鲁棒性相对较差.结论 代谢网络的高模块性不能完全由度序列分布情况来解释,物种代谢网络的鲁棒性和其生活环境密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑浩然	中国科学技术大学计算机科学与技术学院	59	470	10.0	21.0
2	李贵生	中国科学技术大学计算机科学与技术学院	6	105	4.0	6.0