杜仲MEP途径系列基因5'端非编码区的顺式作用元件预测

• 作者: 乌云塔娜 刘慧敏 杜红岩
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杜仲 MEP途径 5'端非编码区 顺式作用元件
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 杜仲研究专栏
• 页码范围: 9-15
• 分类号: S603.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8981.2013.04.002

摘要

为深入了解杜仲MEP途径基因5'端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5'端非编码区顺式作用元件的结构和功能.生物信息学分析表明:EuDXS2基因5'端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5'端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATA-box和32个CAAT-box; EuCMK基因5 '端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box; EuMDS基因5'端非编码区共预测出30种共104个顺式作用元件,其中43个CAAT-box和23个TATA-box; EuHDS基因5'端非编码区预测出35种共126个顺式作用元件,包括29个CAAT-box和34个TATA-box; EuHDR基因5'端非编码区预测出24种共115个顺式作用元件,包含19个CAAT-box和67个TATA-box.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜红岩	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	46	256	8.0	12.0
5	乌云塔娜	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	25	112	6.0	8.0
9	刘慧敏	中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室	10	57	4.0	7.0