杜仲2-甲基-D-赤藓糖醇-2,4-环焦磷酸合酶基因全长cDNA克隆与序列分析

• 作者: 乌云塔娜 刘攀峰 吴敏 杜兰英 杜红岩 黄海燕
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 林木育种学 杜仲 2-甲基-D-赤藓醇-2,4-环焦磷酸合酶(MDS) 基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 页码范围: 410-416
• 页数: 7页
• 分类号: S718.48
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.03.013

摘要

2-甲基-D-赤藓糖醇-2,4-环焦磷酸合酶(MDS)基因曾被认为是调控植物2-甲基-D-赤藓糖醇4-磷酸(MEP)途径的一个关键节点.为解析杜仲MDS基因序列信息和预测基因功能,以叶片cDNA为模板,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)及cDNA末端快速扩增(RACE)技术分离出杜仲MDS基因的cDNA克隆,并通过一系列生物信息学方法进行序列分析.结果表明:EuMDS基因cDNA全长976 bp,5'端非编码区长119 bp,3'端非编码区长146bp,编码236个氨基酸.推导EuMDS氨基酸序列中包含转运肽序列(A1～A56)以及多个植物MDS蛋白保守的功能位点(A84,A87,A89,A121,A213,A217,A221,A223,A228).推导EuMDS蛋白二级结构中α-螺旋占40.3％,β-折叠占13.6％,螺环结构占46.2％.推导EuMDS蛋白三级结构由3个亚单位组成,并相互围绕形成1个分子内腔.系统进化分析表明EuMDS蛋白与啤酒花MDS蛋白亲缘关系最为接近.预测所克隆的EuMDS基因在杜仲萜类生物合成中发挥重要功能.