长链非编码RNA在结肠癌中的表达研究

• 作者: 吴海露 张予蜀 张振玉 曹伟军 袁捷 陈震球
• 来源期刊: 临床肿瘤学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠癌 长链非编码RNA 基因芯片
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 882-886
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3
• 字数: 2542字
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨长链非编码RNA (lncRNA)在结肠癌中的表达情况.方法 从公共数据平台Gene ExpressionOmnibus (GEO)下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织.对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针.用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA.结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据库中76％的ln-cRNA.分析GSE31737发现,与癌旁组织相比,结肠癌组织中共有87个lncRNA差异表达,其中50个高表达,37个低表达.结肠癌与癌旁组织表达值倍数变化＞1.5倍的基因共37个.结论 lncRNA表达在结肠癌组织中发生明显变化,有可能成为结肠癌的分子诊断和基因治疗的新靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹伟军	南京南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科	2	4	1.0	2.0
2	吴海露	南京南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科	1	1	1.0	1.0
3	张予蜀	南京南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科	1	1	1.0	1.0
4	陈震球	南京南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科	1	1	1.0	1.0
5	袁捷	南京南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科	1	1	1.0	1.0
6	张振玉	南京南京医科大学附属南京医院南京市第一医院消化内科	2	4	1.0	2.0