应用MSAP技术研究扇贝全基因组DNA甲基化水平

• 作者: 侯睿 包振民 吕佳 张玲玲 李宁 王宸 王师 胡晓丽
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 扇贝 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 48-53
• 页数: 6页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4746字
• 语种: 中文

摘要

DNA甲基化作为真核生物基因组重要的表观遗传学修饰,对生物体基因的表达有重要的调控作用.为获得扇贝基因组DNA甲基化修饰水平及模式等表观遗传学信息,以栉孔扇贝(Chlamys farreri)、海湾扇贝(Argopecten irradians)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)以及本课题组培育的“海大金贝”为材料,建立了甲基化敏感扩增多态性方法(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)的反应体系,利用该方法对其基因组DNA CCGG区域的甲基化水平进行分析.结果表明,本研究筛选得到的引物组合可用于贝类DNA甲基化的研究,在栉孔扇贝、海湾扇贝、普通虾夷扇贝和“海大金贝”的甲基化比例分别为32.08％、25.99％、32.88％和34.97％.几种扇贝基因组CCGG序列中,胞嘧啶的全甲基化率要高于半甲基化率,推测扇贝基因组中主要的甲基化模式是CpG型.通过对“海大金贝”和普通虾夷扇贝闭壳肌甲基化谱进行比较,筛查得到46个差异位点,这些位点可能参与“海大金贝”闭壳肌积累类胡萝卜素的调控.