小鼠NPC细胞RFX1ChIP-Seq数据分析

• 作者: 刘晓杰 刘选明 张文斗 赵小英 赵志虎
• 来源期刊: 湖南大学学报（自认科学版）
• 关键词: 神经先祖细胞 RFX1 ChIP-Seq
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 化学化工
• 页码范围: 59-65
• 页数: 7页
• 分类号: Q341
• 语种: 中文

摘要

利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells (ESC)与Neural Progenitor Cells (NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均衡；在基因组中结合位点分布区域主要在基因的promoter区域,约有53.2％,其次是intergentic,占22.5％,body区域,占13.1％,enhancer区域,占11.2％.说明RFX1是以结合在基因的promoter区为主要形式对目的基因进行调控.同时在DAVID数据库中用生物信息学方法探索了RFX1靶基因的生物学功能分类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵小英	湖南大学生物学院	33	159	8.0	11.0
2	刘选明	湖南大学生物学院	88	747	16.0	23.0
3	赵志虎	军事医学科学院生物工程研究所	48	447	11.0	20.0
4	张文斗	军事医学科学院生物工程研究所	23	86	5.0	6.0
5	刘晓杰	湖南大学生物学院	1	1	1.0	1.0