慢性移植肾肾病患者外周血差异表达基因的分析

• 作者: 周鸿敏 徐洪来 杨超 肖敏 陈忠华 雒真龙 高义
• 来源期刊: 生物医学工程研究
• 学科: 医学
• 关键词: 肾移植 慢性移植肾肾病 基因表达谱 基因富集 蛋白质相互作用
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 16-21
• 页数: 6页
• 分类号: R318|R392.4|R692.6|Q811.4
• 字数: 4078字
• 语种: 中文

摘要

分析慢性移植肾肾病(CAN)患者与移植物功能稳定肾移植受者外周血基因表达差异,探索CAN免疫致病机制.从GEO数据库获取GSE12187和GSE22229两个肾移植受者外周血的基因芯片表达谱数据集,选取其中13个CAN样本为实验组,15个移植物功能稳定的样本为对照组.以SAM筛选两组样本的差异表达基因.应用DAVID及GENECODIS网络工具对差异基因进行功能富集分析.通过Cytoscape软件的MiMI插件进行差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析.SAM筛选出上调基因168个,下调基因141个.基因富集结果显示,上调基因主要为调控转录和翻译过程的基因,而下调基因参与广泛信号传导通路以及基因表达的调控.Cytoscape软件的PPI分析筛选出19个CAN相关核心基因.CAN患者与移植肾功能稳定受者的免疫功能状态存在显著差异；CAN致病机制涉及免疫细胞复杂的基因表达调控及细胞增值、凋亡、迁移等广泛的信号传导通路变化；免疫细胞在基因的转录、RNA加工、翻译及蛋白质代谢等环节的改变可能在CAN的致病中发挥了关键作用；TAGAP、EIF3F、NUDT21、PAPOLA、RPL等CAN核心基因的免疫调控机制需要深入探索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周鸿敏	华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所	24	44	4.0	5.0
2	杨超	华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所	206	2770	28.0	42.0
3	肖敏	华中科技大学同济医学院附属协和医院皮肤科	52	193	6.0	12.0
4	徐洪来	华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所	8	38	3.0	6.0
5	高义	华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所	3	2	1.0	1.0
6	雒真龙	华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所	4	1	1.0	1.0