永兴岛白穗软珊瑚共附生放线菌筛选及部分活性次级代谢产物的鉴定

• 作者: Kumar Saurav 吴正超 张文军 张长生 朱义广 马亮 黄晖
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 白穗软珊瑚 放线菌 盐水孢菌属 Ⅰ型PKS 利福霉素
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 生理和代谢
• 页码范围: 1063-1071
• 分类号: Q935
• 语种: 中文

摘要

[目的]从白穗软珊瑚中分离和鉴定共附生放线菌,运用PCR技术对所分离的放线菌进行Ⅰ型聚酮合酶(PKS)筛选,研究其次级代谢产物.[方法]使用11种培养基对白穗软珊瑚共附生放线菌进行分离、鉴定,构建16S rRNA基因系统发育进化树,以基于Ⅰ型PKS的KS基因设计的简并引物对所分离放线菌进行基因筛选,对阳性菌株用3种培养基发酵检测,对目标菌株进行放大规模发酵分离鉴定次级代谢产物.[结果]从白穗软珊瑚中分离到20株共附生放线菌,包括链霉菌属10株、迪茨氏菌属2株和盐水孢菌属8株,筛选获得18株Ⅰ型PKS阳性菌株,并从菌株Salinospora arenicola SH04中分离到化合物rifamycin S和rifamycinW.[结论]首次从珊瑚共附生环境中分离得到海洋专属性稀有放线菌盐水孢菌属,并以Ⅰ型PKS基因筛选为指导,分离鉴定了聚酮类化合物rifamycins,为研究软珊瑚共附生可培养放线菌的多样性和基于基因筛选指导分离次级代谢产物提供了可靠依据.