多位点序列分型方法在嗜麦芽窄食单胞菌分子分型中的应用

• 作者: 卢金星 李文革 田国忠
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 嗜麦芽窄食单胞菌 分子分型 多位点序列分型
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1148-1150
• 页数: 3页
• 分类号: R378.2
• 字数: 2466字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.12.004

摘要

目的 建立多位点序列分型方法(Multilocus sequence typing,MLST)分析嗜麦芽窄食单胞菌.方法 提取嗜麦芽窄食单胞菌基因组DNA,选择文献报道的7个嗜麦芽窄食单胞菌管家基因进行PCR扩增,将目的基因PCR产物测序,测序结果与标准序列比对后上传至数据库(http://pubmlst.org/smaltophilia/),获得相应的7对管家基因组成的等位基因谱和序列分型编码(sequence types,STs),应用MLST方法分析68株嗜麦芽窄食单胞菌ST型的流行病学意义.结果 对68株嗜麦芽窄食单胞菌菌株通过多位点序列分型方法分析,所有菌株均为同一新的ST型(ST87),该结果与现场流行病学的关系一致.结论 MLST是一种方便、快速的分子生物学方法,实验室菌株资料可以比较,适用于嗜麦芽窄食单胞菌的进化关系、群体结构和长期的全球分子流行病学研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李文革	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	13	73	5.0	8.0
2	卢金星	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	25	140	7.0	10.0
3	田国忠	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	25	57	4.0	6.0