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铂类耐药相关基因在卵巢癌顺铂耐药形成过程中表达量的动态变化
铂类耐药相关基因在卵巢癌顺铂耐药形成过程中表达量的动态变化
作者:
于红静
李力
王琪
石丽君
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
卵巢肿瘤
卵巢上皮性癌
耐药相关基因
顺铂
基因表达
动态变化
摘要:
目的:了解卵巢癌患者在铂类治疗过程中产生获得性耐药相关基因表达动态变化的情况,为临床预后的预测及个体化治疗奠定理论基础。方法采用Benjamini-Hochberg(BH)法对源于TCGA数据库(The Cancer Genome Atlas)的256例敏感和耐药患者的卵巢癌全基因表达谱数据进行差异表达基因筛选。采用DAVID软件中的KEGG模块对筛选出的差异基因进行通路富集,筛选出P<0.05的通路,对筛选出的通路所包含的基因采用成组t检验找出差异显著的基因(P<0.05)。对筛选出的基因采用COREMINE工具进行文本挖掘,找出与多药耐药及肿瘤耐药存在线性相关的基因,将其与患者预后进行分析,确定存在差异显著的基因。采用实时荧光定量PCR法检测所筛选出的基因在裸鼠诱导耐药模型不同给药阶段的表达变化情况。结果 BH法共筛选出306个差异表达基因,其中上调基因110个,下调基因196个。DAVID软件的KEGG模块分别筛选出5条上调及4条下调通路,成组t检验筛选出有差异的基因共37个,其中上调基因18个,下调基因19个。COREMINE工具检索出与多药耐药及肿瘤耐药存在线性相关的上调基因为ITPA、IMPDH2、RPS7、PDE5A和PDE4D,下调基因为GNAS、CFTR、BUB3、PRKDC、RBL2、SMC1A、CALR、CCNE2及CHEK1。生存分析结果提示CALR及PRKDC基因的表达与患者生存时间有关,CALR和PRKDC基因高表达组的患者生存时间长于低表达组。qRT-PCR检测发现,CALR和PRKDC基因随顺铂注射次数增多,在SKOV3-GFP及SKOV3/DDP英肿瘤组织中的表达量逐渐降低。结论 CALR与PRKDC基因可能与卵巢癌铂类耐药及患者的预后密切相关,且随着耐药的产生,CALR和PRKDC基因的表达量逐渐降低。
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期刊文献
内容分析
关键词云
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相关文献总数
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文献信息
篇名
铂类耐药相关基因在卵巢癌顺铂耐药形成过程中表达量的动态变化
来源期刊
中国癌症防治杂志
学科
医学
关键词
卵巢肿瘤
卵巢上皮性癌
耐药相关基因
顺铂
基因表达
动态变化
年,卷(期)
2013,(3)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
210-215
页数
6页
分类号
R737.31
字数
3709字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-5671.2013.03.05
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李力
广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科
377
1810
20.0
26.0
2
王琪
南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部
2
10
1.0
2.0
3
于红静
南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部
2
23
2.0
2.0
4
石丽君
南宁广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部
1
10
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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引证文献(2)
二级引证文献(3)
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引证文献(1)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
卵巢肿瘤
卵巢上皮性癌
耐药相关基因
顺铂
基因表达
动态变化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国癌症防治杂志
主办单位:
中国医师协会
广西肿瘤防治研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-5671
CN:
45-1366/R
开本:
大16开
出版地:
广西南宁市河堤路71号
邮发代号:
48-33
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
1488
总下载数(次)
0
总被引数(次)
4544
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