顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路富集分析

• 作者: 杨丽华 梁宏 胡万芹 赵庆华 赵洪波
• 来源期刊: 昆明医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 基因表达谱 顺铂耐药卵巢癌 差异表达基因 富集分析
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 97-101
• 页数: 5页
• 分类号: R711
• 字数: 2995字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路.方法 用美国国立信息中心NCBI的GEO数据库获得顺铂耐药卵巢癌基因集GSE15372,通过R与Bioconductor软件进行差异表达基因分析;再利用DAVID在线工具对顺铂耐药卵巢癌差异表达基因进行GO本体分析、KEGG通路分析.结果 差异倍数在2倍以上、FDR值小于0.05为标准,筛选出上调差异表达基因和下调差异表达基因获得差异表达基因211个,其中上调基因120个,下调基因91个;基因富集分析发现差异表达基因集中在黏着斑、TGF-β信号通路等生物过程(P＜0.05).结论 顺铂耐药卵巢癌存在一些特异的差异表达基因,有部分信号通路在顺铂耐药卵巢癌中明显富集.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨丽华	昆明医科大学第二附属医院妇产科	69	195	7.0	10.0
2	赵庆华	昆明医科大学第二附属医院妇产科	24	78	5.0	8.0
3	胡万芹	昆明医科大学第二附属医院妇产科	11	47	4.0	6.0
4	赵洪波	昆明医科大学分子临床医学研究院	10	18	2.0	3.0
5	梁宏	昆明医科大学第二附属医院妇产科	7	32	3.0	5.0