基于线粒体控制区变异的水牛群体遗传分析

• 作者: 刘庆友 崔奎青 李秀林 王志强 石德顺
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水牛 线粒体控制区 多态性
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学与兽医学
• 页码范围: 76-82
• 页数: 7页
• 分类号: S823
• 字数: 6105字
• 语种: 中文

摘要

为探讨沼泽型水牛与河流型水牛之间的线粒体D-loop区差异与进化关系,对26头广西本地水牛、8头贵州贵阳水牛、11头广西水牛与河流型水牛杂交后代、9头尼里拉菲和12头摩拉水牛(共5个群体66头水牛个体)的线粒体全长D-loop序列进行了扩增测序分析.结果发现66头水牛912 bp的D-loop多重序列比较有147个多态位点,形成58个单体型,沼泽型水牛与河流型水牛单体型明显分成2簇.以牛为外群构建的单体型进化树显示,沼泽型与河流型水牛分成明显2大支,河流型水牛聚成1支,而沼泽型水牛内部又分成2个侧支.通过Median joining network分析亦发现3个不同的簇,与进化树分析结果一致.对该区碱基错配分布分析表明,水牛群体在历史上发生2次独立的群体扩增事件.为进一步验证试验结果,从GenBank下载了211条水牛D-loop序列与笔者研究获得的序列整合分析,在共有序列878 bp区域中,包含了158个多态位点和129个单体型,以牛为外群的进化树分析与单体型网络分析表明,沼泽型水牛分成2簇,所有的河流型水牛聚集成紧密的1簇.碱基错配分布分析结果呈现2个明显的峰,进一步推断水牛群体在历史上发生过2次较大的群体扩增事件.综合上述研究结果推断,沼泽型水牛与河流型水牛来自不同的家养化事件,沼泽型水牛起源于中国,其祖先可能存在2个基因池.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石德顺	广西大学动物科学技术学院	241	1058	14.0	21.0
2	刘庆友	广西大学动物科学技术学院	54	200	7.0	11.0
3	崔奎青	广西大学动物科学技术学院	40	151	6.0	10.0
4	李秀林	广西大学动物科学技术学院	6	21	3.0	4.0
5	王志强	广西大学动物科学技术学院	16	64	5.0	7.0