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华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征
华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征
作者:
刘媛
刘美伶
周碧波
杨尚波
王伟炳
王学高
蒋伟利
陆怀初
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
结核分枝杆菌
VNTR-MIRU
基因分型
成簇
摘要:
目的 评价VNTR-MIRU分型方法在结核病流行病学中的应用,并描述华东部分农村地区结核分枝杆菌的基因型分布及成簇特征.方法 对浙江省宁波市鄞州区及江苏省盐城市阜宁县从2009年6月1日至2010年11月31日登记的结核病患者的结核分离菌株采用VNTR-MIRU方法进行分型,通过Hunter-Gaston指数(HGI)及遗传差异值(h)对MIRU位点进行分辨力及遗传差异性评价,同时进行问卷调查以收集患者的社会人口学及临床治疗信息.结果 在297株结核杆菌分离株中发现了281种基因型,近期传播比例为5.4%,MIRU位点组合的分辨力(HGI)为0.9995,7个位点的分辨力大小依次为:VNTR3820> Qub18> Qub11a>MIRU26>Qub11b>Mtub21>Qub26,位点的h大小排序与分辨力的大小排序相同,遗传差异性最大的位点为VNTR3820(h=0.8794),最小的为Qub26(h=0.6613).比较两个研究地区的结核枝杆菌成簇特征,阜宁县菌株成簇率为19%,而鄞州区无菌株成簇,均呈现“唯一”基因型,这种差异的产生很可能与当地的人口迁徙有关.结论 7位点VNTR-MIRU分型法对结核枝杆菌进行分型简便快速,而且具有较高的分辨力,适合于结核的大规模快速检测.我国华东农村地区结核的流行以既往感染复燃为主,并存在一定比例的近期传播.
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文献信息
篇名
华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征
来源期刊
复旦学报(医学版)
学科
医学
关键词
结核分枝杆菌
VNTR-MIRU
基因分型
成簇
年,卷(期)
2013,(4)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
400-406
页数
7页
分类号
R378.91+1
字数
4248字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1672-8467.2013.04.005
五维指标
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节点文献
结核分枝杆菌
VNTR-MIRU
基因分型
成簇
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
复旦学报(医学版)
主办单位:
复旦大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-8467
CN:
31-1885/R
开本:
大16开
出版地:
上海医学院路138号 285信箱
邮发代号:
4-262
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
3888
总下载数(次)
4
总被引数(次)
25666
相关基金
教育部留学回国人员科研启动基金
英文译名:
the Scientific Research Foundation for the Returned Overseas Chinese Scholars, State Education Ministry
官方网址:
http://www.csc.edu.cn/gb/
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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