肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型分离株的VP1基因特征分析

• 作者: 孟继鸿 张建华 江炳福 游贤惠 程险峰
• 来源期刊: 东南大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A16型 VP1 基因特征
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 173-179
• 页数: 7页
• 分类号: R512.5
• 字数: 2980字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6264.2013.02.011

摘要

目的:探讨苏皖地区手足口病(HFMD)患者肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因特征.方法:采集南京市、马鞍山市2009至2010年HFMD患者临床标本进行病毒分离和RT-PCR鉴定;扩增并测定VP1基因序列;从GenBank中选取EV71和CA16不同基因型参考毒株,利用生物信息学软件进行同源性比对和系统进化树分析.结果:共分离到9株EV71和4株CA16,EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.5% ～99.8%和99% ～100%;CA16分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性为96.2% ～98.5%和99.3% ～100%;系统进化树分析显示,9株EV71全部属于C4a基因亚型,而4株CA16则全部属于B1b基因亚型.结论:2009至2010年苏皖地区分离到的EV71和CA16毒株分别属于C4a和B1b基因亚型,与国内其他地区HFMD病原学及分子进化研究结果一致,有望成为疫苗候选株作进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张建华	东南大学医学院	23	142	7.0	11.0
3	孟继鸿	东南大学医学院	43	346	9.0	17.0
4	程险峰	东南大学医学院	4	60	3.0	4.0
5	江炳福	东南大学医学院	3	17	1.0	3.0
8	游贤惠		2	15	1.0	2.0