东方百合SRAP体系优化及引物筛选

• 作者: 丁信誉 席梦利 施季森 邱帅
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 东方百合 序列相关扩增多态性分子标记 体系优化 引物筛选
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: Q949.71+8|Q75
• 字数: 3384字
• 语种: 中文

摘要

以东方百合商品种‘索蚌’(‘Sorbonne’)和‘康斯坦撒’(‘Constantsa’)及其F1代杂交群体为实验材料,从100对SRAP引物中筛选出59对扩增产物丰富、具有较高多态性的引物,同时对PCR反应体系进行了优化.采用正交设计,对Mg2+、dNTPs、Taq聚合酶及引物浓度进行4因素4水平优化,并在此基础上对Mg2+、引物浓度和退火温度进行了单因素优化.结果表明,东方百合SRAP的最佳体系为:1×Buffer,Mg2+浓度2.7 mmol/L,dNTPs浓度0.25 mmol/L,引物浓度0.8μmol/L,Taq聚合酶1.5 μmol/min,模板DNA 60～100 ng.SRAP两步反应最佳退火温度为第1步35℃,第2步退火59.3℃.最后用‘索蚌’、‘康斯坦撒’和部分F1植株对优化体系进行稳定性检测,发现所筛选出的59对引物在优化的体系下均有稳定的扩增产物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	席梦利		50	504	13.0	19.0
2	施季森		218	3785	32.0	50.0
3	邱帅		4	52	4.0	4.0
4	丁信誉		2	36	2.0	2.0