菊科BRC1-like基因片段的克隆与进化分析

• 作者: 刘凤栾 刘勇 李俊香 赵梁军 赵瑞艳 郗琳 陈晓丽
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 菊科 BRC1 TCP 基因复制 分子进化
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 650-658
• 页数: 9页
• 字数: 6524字
• 语种: 中文

摘要

菊科(Asteraceae)植物在进化中产生了丰富的分枝类型,而分枝类型的多样性源于分枝相关基因的多样性.BRC1 (BRANCHED1)基因作为TCP家族的成员,已被验证具有抑制侧枝伸长的功能,且该家族的基因具有较快的进化速度.本文研究了BRC1-like基因的进化模式,该基因在进化中多次复制,且不同成员受到不同的选择压,这些可能是该家族成员众多及功能多样性的基础.本研究以菊科16个种为材料,克隆得到21个BRC1-like基因的片段,均包含保守的TCP结构域,R结构域,以及ECE模体,属于TCP家族中的CYCLOIDEA1 (CYC1)亚簇.结合NCBI中得到的非洲菊(Gerbera hybrid)和向日葵(Helianthus annuus)的BRC1-like基因序列,构建系统发育树,结果表明,CYC1亚簇在菊科中又分为两组,分别命名为BRC1a和BRC1b,表明此亚簇在形成后又进行了复制.利用最大似然分枝检验的方法,对其进化选择压进行检验,结果表明,BRC1b受到了强烈的纯化选择,而BRC1a受到的选择压减小.进一步运用最大似然分枝-位点检验的方法,证明BRC1a受到中性选择,而未受正选择.利用最大似然位点检验的方法,检测了BRC1-like基因片段受到纯化选择和中性选择的位点,结果表明纯化选择的位点主要集中在TCP和R结构域,以及ECE模体,证明两组基因的主要结构域在进化中被固定.菊科植物中BRC1-like基因片段的进化表明,该基因首先通过复制成为两组,而这两组受到了不同的选择压,可能会导致产生不同的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵梁军	中国农业大学观赏园艺与园林系	108	1169	20.0	27.0
2	陈晓丽	中国农业大学观赏园艺与园林系	26	138	7.0	10.0
3	郗琳	中国农业大学观赏园艺与园林系	7	35	4.0	5.0
4	刘凤栾	中国农业大学观赏园艺与园林系	12	79	6.0	8.0
5	李俊香	中国农业大学观赏园艺与园林系	13	49	4.0	6.0
6	刘勇		1	3	1.0	1.0
7	赵瑞艳	中国农业大学观赏园艺与园林系	2	10	2.0	2.0