甘蓝型油菜ADC基因片段的克隆及序列分析

• 作者: 刘正富 李晨 洪林 闫晓红 魏文辉
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 精氨酸脱羧酶(ADC)基因 同源克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 135-140
• 分类号: S635
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2012.02.135

摘要

[目的]克隆甘蓝型油菜精氨酸脱羧酶(ADC)基因的cDNA片段,为进一步获得ADC基因全长及研究其的生物学功能奠定基础.[方法]以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)品种中双6号的花蕾为材料,设计简并引物,采用同源克隆法扩增ADC基因的cDNA片段.[结果]成功扩增获得8个不同的ADC基因拷贝,按长度将其分为1011、999、981 bp 3类,8个拷贝核苷酸序列之间的同源性为81％～99％,其推导氨基酸序列之间的同源性为86％～99％.1011 bp片段包含3种不同的序列S1 ～S3,序列间存在9个单核苷酸多态性(SNP)位点.999 bp序列包含S4和S5,具有3个SNP位点,两个区段出现连续碱基缺失.981 bp序列包含S6～S8,发现14个SNP位点,且第67位核苷酸出现无义突变,4个区段发生碱基缺失.序列S4～S8共同缺失第632～634、642～650位的核苷酸小片段.氨基酸同源比对和系统进化分析结果表明,8个不同ADC基因拷贝与芥菜(Brassica juncea L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)、盐芥(Thellungiella halophila L.)等物种的ADC基因同源性高,亲缘关系近.[结论]所获得的8个基因拷贝即为来自于甘蓝型油菜ADC基因的片段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘正富	重庆市农业科学院果树研究所	7	38	3.0	6.0