小麦抗叶锈病基因LrAlt的比较基因组学分析

• 作者: 伊黛舒 刘志勇 唐华山 彭惠茹 彭福祥 李保云 沈红霞 王艳洁 解超杰
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦叶锈病 LrAlt 比较基因组学 EST-STS SSR
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 页码范围: 1-6
• 分类号: S512.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2013.04.01

摘要

斯卑尔脱小麦材料Altgold含有小麦抗叶锈病基因LrAlt.该基因被定位于小麦2A染色体短臂末端.本研究基于小麦与短柄草和水稻基因组良好的共线性关系,对小麦抗叶锈病基因LrAlt进行比较基因组学分析,发现该基因所在基因组区域对应于短柄草第5染色体和水稻第4染色体的直系同源基因组区域,据此开发出与LrAlt连锁的EST-STS标记BE498683、BF471132.1、BG605273和CD454629,并构建了LrAlt的遗传连锁图谱,这4个EST-STS标记与Xba rc212共分离,位于LrAlt近着丝粒侧,距离LrAlt1.9 cM.同时,通过筛选Graingenes 2.0公布的位于LrAlt附近的SSR标记,发现Xbarc124、Xgwm614与LrAlt紧密连锁,均与Xbarc212共分离.本研究通过比较基因组学的策略和筛选Graingenes 2.0公布的SSR标记,共得到与LrAlt紧密连锁的9个新的分子标记,为构建LrAlt的高密度精细遗传连锁图谱、分子标记辅助选择和基因聚合奠定了基础.