从福尔马林固定-石蜡包埋样本中抽提RNA的方法与可行性

• 作者: 任牡丹 卢新兰 和水祥 张宁 朱萌
• 来源期刊: 临床与实验病理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 福尔马林固定-石蜡包埋 RNA抽提 方法
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 301-305
• 页数: 5页
• 分类号: R331
• 字数: 3983字
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨从福尔马林固定-石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)组织中抽提RNA的可行性和有效性.方法 收集胃癌和癌旁FFPE样本各41例,10 μm厚连续切片3张,采用蛋白酶消化盐析法抽提纯化RNA,检测提取RNA的产量和质量并分析其应用价值.结果 41对胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度为1.578 ～3.175,平均2.022 ±0.190,其中癌组织为1.578 ～3.175,平均2.033±0.240,癌旁组织为1.726 ～2.329,平均2.011±0.123;RNA浓度为(26.8 ～1 087) ng/μl,平均(267.062±210.435) ng/μl,其中癌组织为(50.5 ～1 087) ng/μl,平均(336.5±228.927) ng/μl,癌旁组织为(26.8～820) ng/μl,平均(197.62±165.47) ng/μl;琼脂糖凝胶电泳条带弥散分布,约300bp;胃癌和癌旁RNA的纯度比较P=0.564,尚不能认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度有不同,但浓度比较P=0.001,可认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA浓度有所不同,癌组织中较高.结论 从FFPE样本中抽提的RNA在不可避免地出现降解的情况下仍然具有很高的纯度和合适的浓度；在确保扩增产物大小处于一定范围内的前提下从FFPE样本中抽提的RNA具有可以满足下游应用的纯度、浓度和完整性；建立从FFPE样本中抽提RNA的方法在各种影响因素符合要求后完全可行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张宁	宁夏医科大学总医院病理科	34	91	5.0	7.0
2	和水祥	西安交通大学医学院第一附属医院消化内科	102	703	16.0	21.0
3	朱萌	西安交通大学医学院第一附属医院消化内科	8	13	3.0	3.0
4	任牡丹	西安交通大学医学院第一附属医院消化内科	23	166	7.0	12.0
5	卢新兰	西安交通大学医学院第一附属医院消化内科	17	117	7.0	10.0