广东新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子进化与变异

• 作者: 何剑峰 张欣 杨芬 梁丽君 武婕 苏文哲 邹丽容 钟静 黄平
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 新型H1N1病毒 血凝素 表位 进化 变异
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 173-177
• 页数: 5页
• 字数: 3942字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2013.03.003

摘要

目的 揭示广东地区2009-2011年新型H1N1病毒血凝素基因(HA)进化特征及抗原表位变异特征.方法 采用时空抽样方法抽样,检测2009-2011年广东分离的24株新型H1N1病毒HA基因核苷酸序列,与GenBank中44株国外相应序列比较；比对HA基因核苷酸序列,分析基因分子变异,构建分子遗传动力学MCMC进化树；同时分析2009-2011年广东毒株HA基因的抗原表位变异情况.结果 68株HA基因进化树显示,广东毒株进化树主干至少分为6大分支；其中2011年毒株聚类为2个(Ⅴ和Ⅵ)主要分支,各具基因特征.变异频率较高的位点包括391、467、202和214位,正向选择位点包括8、145和391；广东毒株抗原表位区发生S145L/P、L208I、Q240R、S160G和G187R位点变异.2009年广东毒株HA基因分支Ⅰ毒株可能于2010年传播到亚洲、欧洲和澳洲地区.结论 广东新型H1N1病毒HA基因变异具有传播特征(Ⅰ)和地区特征(Ⅵ),位于抗原表位Ca、Sa和Sb的氨基酸发生变异,其中位点145等变异频率较高,承受着正向选择压力.