影响猪免疫性状的单倍型关联分析

• 作者: 宋欣 张龙超 李勇 王立刚 程笃学 罗维真 陈少康 颜华 马小军
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 免疫性状 单倍型 关联分析 猪
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 843-852
• 页数: 10页
• 分类号: S828|S813.3
• 字数: 4662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2013.06.003

摘要

旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因.应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因.分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著；8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因.结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究.