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摘要:
根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)侵染植物会引起感染细胞的基因转录发生变化.明确其间的基因转录模式,有助于揭示农杆菌的致病机理和改善农杆菌介导的遗传转化技术.本研究采用RAM(ranking analysis of microarray data)统计方法,分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)受伤和接种农杆菌GV3101后第3小时至第6天的转录组变化,采用MapMan软件分析所得差异转录基因的功能类别与分布.结果显示,农杆菌GV3101导致4 651个基因差异转录,而受伤时有3 885个基因的转录发生改变,两者之间有1 045个相同基因.接种农杆菌GV3101后拟南芥基础代谢相关的差异转录基因数目减少,并且使胁迫途径中植物致病相关蛋白(pathogenesis-related proteins,PRproteins)的编码基因转录变化显著,其中37个NB-LRR (nucleotide-binding site,leucine-rich repeat)型抗病蛋白(resistance proteins,R proteins)的编码基因转录水平明显下降.受伤时只有6个NB-LRR型蛋白的编码基因转录下调.研究结果表明,接种根癌农杆菌GV3101后拟南芥细胞的转录模式明显改变,抗病能力受到抑制,有利于农杆菌T-DNA的整合和致病.
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文献信息
篇名 拟南芥受伤和接种根癌农杆菌GV3101对转录的影响
来源期刊 农业生物技术学报 学科
关键词 拟南芥 受伤花梗 根癌农杆菌GV3101 转录组
年,卷(期) 2013,(5) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 537-545
页数 9页 分类号
字数 4673字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.05.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张兴国 45 297 10.0 14.0
2 苏承刚 25 130 8.0 10.0
3 谭远德 湖南师范大学生命科学学院 20 429 9.0 20.0
4 肖卫民 1 1 1.0 1.0
5 赵名琛 1 1 1.0 1.0
6 邹敏 6 51 5.0 6.0
7 杜小兵 6 52 3.0 6.0
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研究主题发展历程
节点文献
拟南芥
受伤花梗
根癌农杆菌GV3101
转录组
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
出版文献量(篇)
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8
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