不同羊毛纤维直径细毛羊皮肤组织差异表达基因研究

• 作者: 于丽娟 吴伟伟 哈尼克孜·吐拉甫 张艳花 徐新明 拉扎提·艾尼瓦尔 狄江 田可川 田月珍
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 细毛羊 纤维直径 基因表达 基因芯片
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 681-689
• 页数: 9页
• 分类号: S826|S813.3
• 字数: 6087字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2013.05.003

摘要

为了筛选不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织中的差异表达基因,本研究利用Agilent公司绵羊表达谱芯片和Affymetrix公司牛表达谱芯片对不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织mRNA进行了芯片杂交;运用Significance Analysis of Microarrays (SAM)法对基因表达谱进行了差异分析;并通过分子注释系统平台(MAS3.0)对差异表达基因进行了功能富集类分析和调控通路分析;通过实时定量PCR对部分差异表达基因进行了验证.芯片试验共检测到267个差异表达的基因,其中上调基因106个,下调基因161个.Kegg和GO分析表明,参与细胞凋亡、增殖及分化、蛋白质代谢、Wnt信号通路以及羊毛角蛋白结构等生物学过程的多个基因表达水平发生了显著变化.所验证的差异表达基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致.结果表明,不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织的基因表达谱存在差别,这些基因的不同表达可能通过改变皮肤毛囊和羊毛分化过程影响被毛纤维直径.这些基因的发现将为进一步筛选影响羊毛纤维直径性状的重要候选基因/分子标记提供研究基础.