3株人源猪链球菌2型湖南株cps2J、gdh、ef基因进化分析

• 作者: 姚栋 孙边成 宋克云 张如胜 杨柳青 欧新华 肖姗 苏良
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 猪链球菌2型 cps2J基因 gdh基因 ef基因 进化分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 369-374
• 页数: 6页
• 分类号: R378.1
• 字数: 4125字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.04.011

摘要

目的 对3株人源猪链球菌2 型(S.suis 2)湖南株(HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102)cps2J、gdh、ef基因进行序列测定和进化分析,了解其变异和进化状况,为人感染S.suis疫情的防控提供数据.方法设计S.suis 2 cps2J、gdh、ef基因PCR引物,对HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102株进行PCR扩增和序列测定,测序结果利用Lasergene 和Mega5软件进行分析.结果 cps2J、gdh、ef基因包含的完整开放阅读框( ORF) 分别为999 bp、1 347 bp、2 532 bp,分别编码333、448、843个氨基酸.在线BLAST 同源性分析表明,HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102 株属于S.suis 2,3菌株cps2J、gdh、ef 基因组序列之间的核苷酸同源性均为100%;进化树显示,HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102 株与国内外猪源和人源S.suis 2 菌株属于同一分支,同源性比较显示3株S.suis 2 湖南分离株cps2J、gdh、ef基因与其他国内外S.suis 株核苷酸序列同源性分别为99.8%~100%、96.4%~100%和99.7%~100%,氨基酸同源性分别为98.5%~100%、98.7%~100%和99.5%~100%.结论 3 株人源S.suis 2 湖南株cps2J、gdh、ef基因序列与国内外S.suis 2 菌株相应基因序列同源性高,变异程度小.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	欧新华		42	155	7.0	8.0
2	张如胜		29	127	7.0	9.0
3	苏良		17	100	7.0	9.0
4	杨柳青		12	58	5.0	7.0
5	肖姗		5	27	3.0	5.0
6	姚栋		15	48	5.0	6.0
7	宋克云		19	77	6.0	8.0
8	孙边成		21	46	4.0	5.0