云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS基因进化分析

• 作者: 冯子良 刘庆亮 张文东 段博芳 肖雪 胡挺松 赵焕云 邱薇 郑颖
• 来源期刊: 中华流行病学杂志
• 关键词: 禽流感病毒 H5N1亚型 非结构蛋白1 非结构蛋白2或核输出蛋白 遗传分析
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 实验室研究
• 页码范围: 491-495
• 页数: 5页
• 字数: 3067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2013.05.018

摘要

目的 阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS1 、NS2基因变异特征及遗传进化关系.方法 在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5N 1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品对病毒NS基因进行扩增,克隆至pMD 18-T载体测序,获得NS1、NS2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析.结果 自1240份样品中检出H5N1亚型阳性样品71份,阳性率为5.72％；30份代表性阳性样品病毒NS基因测序获得17种序列,存在3个不同进化(亚)分支(Ⅰ-1、Ⅰ-2、Ⅱ)；NS1/NS2基因与病毒血凝素(HA)基因呈现不同进化关系；NS1蛋白涉及核定位信号区、RNA结合区、效应区及其他致病性相关的关键性氨基酸位点存在替代或突变.结论 云南边境地区H5N1亚型病毒NS1/NS2基因具有遗传差异,2010年以来NS基因进化分支Ⅰ-2、Ⅱ已成为当地流行的优势毒株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯子良		28	117	5.0	9.0
2	郑颖		71	254	9.0	12.0
3	邱薇		70	283	9.0	13.0
4	胡挺松		25	54	4.0	6.0
5	张文东		18	58	5.0	6.0
6	赵焕云		16	44	3.0	5.0
7	段博芳		13	19	3.0	3.0