巴曲酶的线性和构象型B细胞抗原表位的预测

• 作者: 姜秀萍 尹茂鲁 杨青 贾秋磊 陈琦 陈磊
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 巴曲酶 免疫原性 线性表位 构象型表位 同源模建
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 免疫学技术与方法
• 页码范围: 1193-1197,1201
• 页数: 6页
• 分类号: R34
• 字数: 3325字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-484X.2013.11.016

摘要

目的:预测巴曲酶的B细胞线性表位和构象型表位,本项目的预期成果可为该药物的安全化应用提供新思路.方法:基于巴曲酶的蛋白质序列,采用DNAStar软件和ABCpred、BCPREDS、BcePred和BepiPred 1.0服务器预测巴曲酶的线性表位.以蝮蛇毒蛋白C激活剂蛋白的晶体结构为模板,利用MODELLER9.10软件中的Pythonwin程序进行该酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行合理化评价.根据巴曲酶的模建三维结构并结合DiscoTope和cons PPISP网络数据库预测构象型抗原表位.结果:得到肽端AA3~9、19~31、57~82、93~101、106~114、127~142、171~183、196~208、223~230区域为巴曲酶的B细胞线性表位优势区域.然后得到蛋白的N端41~48、57~71、76~82、93~100、109~115、127~133、146~152、194~203区段为B细胞构象型表位区域.结论:这些B细胞抗原表位可为降低巴曲酶的免疫原性提供实验依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜秀萍	大连理工大学生命科学与技术学院	9	72	3.0	8.0
2	杨青	大连理工大学生命科学与技术学院	29	142	7.0	11.0
3	陈磊	大连理工大学生命科学与技术学院	13	84	5.0	9.0
4	贾秋磊	大连理工大学生命科学与技术学院	3	7	2.0	2.0
5	陈琦	大连理工大学生命科学与技术学院	5	36	3.0	5.0
6	尹茂鲁	大连理工大学生命科学与技术学院	1	1	1.0	1.0