基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

• 作者: 周旻纯 孟学平 彭永兴 易乐飞 申欣 程汉良 董志国 陈冬勤
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 帘蛤科 线粒体DNA 细胞色素c氧化酶亚基I 系统发生
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 个体与基础生态
• 页码范围: 2744-2753
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201202030140

摘要

对21种帘蛤科贝类线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为707 bp(含引物),序列A+T含量(62.4％-67.8％)明显高于G+C含量.物种间共有变异位点379个,其中简约信息位点334个；此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点100个.以COI基因片段序列为标记,用中国蛤蜊(Mactra chinensis)作外群,构建了35种帘蛤科贝类(其中14种贝类COI序列从GenBank下载)的系统发生树,结合拓扑结构分析和序列比对分析,结果表明:支持将短文蛤(Meretrix petechinalis)和丽文蛤(M.lusoria)订为文蛤(M.meretrix)的同物异名的观点,建议将丽文蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种；支持将薄片镜蛤(Dosinia corrugata)和D.angulosa订为2个独立种的观点；认为将波纹巴非蛤(Paphia undulata)和织锦巴非蛤(P.textile)订为2个独立种是合适的.COI基因序列含有丰富的遗传信息,适合作为帘蛤科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.